Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms