Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms