Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms