Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms