Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms