Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IMPG1Q17R60 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IMPG1Q17R60 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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