Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM1Q16610 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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