Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTRK3Q16288 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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