Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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