Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDK3Q15120 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms