Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HDM1Q15032 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
R3HDM1Q15032 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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