Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP1BQ14684 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP1BQ14684 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
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