Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDC1Q14676 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms