Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BECN1Q14457 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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