Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IKBKEQ14164 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms