Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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