Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TUBB2AQ13885 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB2AQ13885 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms