Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA1SQ13698 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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