Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms