Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCIRG1Q13488 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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