Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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