Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFSWAPQ12872 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFSWAPQ12872 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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