Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH2Q12809 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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