Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EFEMP1Q12805 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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