Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CGNL1Q0VF96 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms