Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLFN5Q08AF3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms