Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms