Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP1Q07960 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGAP1Q07960 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms