Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SOS1Q07889 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOS1Q07889 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms