Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLEQ07864 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLEQ07864 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLEQ07864 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLEQ07864 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms