Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CXCL9Q07325 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CXCL9Q07325 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms