Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALD1Q05682 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms