Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKCDQ05655 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms