Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2BQ02880 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 645.4 ms