Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM2Q00987 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDM2Q00987 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms