Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF9Q00978 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms