Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms