Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms