Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNB1P98172 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms