Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS9P82933 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS9P82933 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms