Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMF1P82094 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMF1P82094 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMF1P82094 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMF1P82094 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMF1P82094 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TMF1P82094 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMF1P82094 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMF1P82094 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TMF1P82094 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMF1P82094 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMF1P82094 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms