Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNB1P62873 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms