Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB1AP62820 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms