Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P62684 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms