Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF6P62330 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF6P62330 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ARF6P62330 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ARF6P62330 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms