Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RPS29P62273 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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