Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2FP61218 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms