Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIK1P57059 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SIK1P57059 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIK1P57059 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIK1P57059 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIK1P57059 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms