Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GFRA1P56159 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA1P56159 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms