Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L1P55209 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAP1L1P55209 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NAP1L1P55209 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NAP1L1P55209 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NAP1L1P55209 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms